水空調和普通空調（這里的普通空調通常指傳統的氟利昂空調）的區別主要體現在以下方面：
工作原理：水空調是利用水蒸發來吸收熱量，通過水泵將地下水抽上來，經過室內的風機盤管實現制冷，回水經管道流回地下，冬天則通過類似的循環達到制熱目的；普通空調大多采用 “蒸氣壓縮循環”，通過壓縮機、蒸發器、冷凝器等部件，利用制冷劑的狀態變化來實現制冷制熱。
舒適度：水空調的制冷出風溫度相對較高，在 15-20 攝氏度左右，出風更柔和，溫度傳遞平穩，且以水為媒介，傳熱更穩定，可避免送風溫度波動，人體感受更舒適；普通空調制冷時吹出的風溫度較低，可能導致室內溫度驟變，忽冷忽熱對人體有一定刺激性。另外，水空調系統包含除濕新風機，能較好地控制室內濕度，而普通空調制冷時可能會使室內空氣過于干燥。
健康性：水空調無需使用氟利昂作為制冷劑，沒有化學污染和廢氣廢熱排放，不會產生對大自然有污染的物質。一些水空調系統還配備有空氣凈化設備，能改善室內空氣質量；普通空調的密閉空間可能導致空氣流動性差，容易滋生致病微生物，且氟利昂的使用或泄漏可能對環境和人體健康有一定影響。
穩定性：水空調的室內機和室外機相對獨立，互不影響，室外主機完成制冷 / 制熱循環的所有過程，系統穩定性較高；普通空調的室內機和室外機共同組成制冷系統，一臺室內機或室外機發生故障時，可能會影響整個系統的平衡和運轉，穩定性相對較低。
能耗：水空調耗電量相對較小，通常情況下，其單位時間耗電量比普通空調少很多；普通空調的耗電量相對較高。
安裝和維護：水空調安裝時需要考慮室內排水和主機位置等因素，以確保主機散熱良好和排水順暢，并且其運行過程中可能會增加室內潮濕度，需要注意通風換氣，還要定期清理過濾網等部件；普通空調安裝相對簡便，但也需要專業人員進行安裝和維護。
環保性：水空調使用水作為介質，較為環保；普通空調使用的氟利昂等制冷劑可能對環境有一定影響，如破壞臭氧層等。
需要注意的是，水空調在實際應用中可能存在一些局限性，例如降溫幅度可能不如普通空調，對溫度要求嚴格的場所可能不太適用；空氣通過水幕后濕度會有所增加，對于濕度要求高的地方也需謹慎考慮。在選擇空調時，需根據具體的使用場景、需求以及當地的氣候條件等因素進行綜合考量。