常見的消毒柜消毒方式包括紅外線消毒、紫外線消毒、臭氧消毒等，以及多種方式的組合。不同消毒方式各有特點，家用時可以根據實際需求進行選擇。
紅外線消毒屬于高溫消毒，通過遠紅外線作為熱源產生高溫并以輻射方式傳播，進而滅菌消毒，一般在 120℃左右高溫加熱 10-15 分鐘。這種消毒方式適合普通陶瓷、不銹鋼等耐高溫的物品，但高溫容易損壞釉面，高檔餐具如骨瓷等，以及木制筷子、塑料類、玻璃類不耐高溫的物品和毛巾等棉織類物品不適合用紅外線高溫消毒。
紫外線消毒利用紫外線破壞細菌復制能力，屬于中低溫消毒，可消毒的品類更廣泛，除日常陶瓷餐具外，木制、玻璃、塑料等不可高溫消毒的餐具都可以。不過，紫外線消毒可能存在照射不到的死角，影響消毒效果。
臭氧消毒也屬于中低溫消毒，其原理是將空氣中的氧氣合成強氧化劑 —— 臭氧，使細菌的蛋白質外殼氧化變性，可殺滅多種病毒、細菌等。但臭氧消毒時間長，且消毒過的餐具上可能殘留臭氧，會刺激人體呼吸道，存在一定安全隱患。
為了兼顧不同材質餐具的消毒需求，并提高消毒效果，現在一些消毒柜采用了組合消毒方式，如紫外線和光波巴氏雙物理因子協同作用消毒。例如，海爾光波巴氏消毒柜的雙層柜室，上室采用 60℃紫外 C 波巴氏中溫消毒，為純物理消毒方式，無需擔心有害物質遇高溫析出，可用于塑料、奶瓶奶嘴等不耐高溫餐具的消毒烘干；下室 90℃寬頻光波巴氏高溫消毒，可用于骨瓷碗碟、玻璃酒杯、不銹鋼筷子等餐具。
在選擇家用消毒柜時，還需考慮家庭人口數量、擺放空間、消毒柜的大小、外觀材質等因素。一般來說，五口之家選擇容積 40L-70L 的消毒柜基本夠用，嵌入式或壁掛式消毒柜比較適合；若家里人口多且空間大，可選擇立式消毒柜。從外觀材質上看，不銹鋼材質的消毒柜易清潔、耐腐蝕，是較好的選擇。此外，還需關注消毒柜的功能和價格，質量越好、功能越多，價格通常也越高，可以根據個人需求和預算來挑選合適價位的產品。
購買消毒柜時，建議選擇知名品牌的產品，并注意查看產品的消毒等級、認證標志等，以確保其消毒效果和質量安全。同時，使用消毒柜時也要按照說明書正確操作，定期清潔和維護，以保證消毒柜的正常使用和消毒效果。